Flaggselskapet i Malaysia , Malaysia Airlines (MH), flyr non-stop til omtrent 60 destinasjoner. Disse inkluderer steder i Malaysia, i tillegg til internasjonale destinasjoner i Asia, Australia, Europa, Midtøsten og New Zealand. Selskapets flåte tilbyr fly konfigurert med tre kabiner (Første klasse, business klasse og økonomiklasse) og to kabiner (Business klasse og økonomiklasse). Malaysia Airlines opererer to primærknutepunkt ved Kuala Lumpur International Airport (KUL) og Kota Kinabalu International Airport (BKI), i tillegg til et sekundærknutepunkt ved Kuching International Airport (KIA). Selskapet er en del av oneworld-alliansen, og har også samkjøringsavtaler med omtrent 30 andre operatører.